Project Details
Description
小型非編碼核醣核酸在細胞內扮演重要的調控功能，若他們的功能異常則會引起多種人類的疾病如癌症。要了解他們的功能首先得知道他們調控的基因是那些，因此，本三年期計畫預計要以計算的方式來偵測兩種小型非編碼核醣核酸(piRNA及tRFs)之調控目標RNA。本計畫第一年要開發深度學習演算法來預測一條RNA上面可能有哪些piRNA的結合位置。用深度學習演算法來解這個問題非常創新，目前文獻中尚無任何相關論文。本計畫第二年要將深度演算法訓練出來的網路模型包裝成網頁工具並拿來預測線蟲內每個基因的mRNA上面可能有哪些piRNA的結合位置並將結果整理成資料庫供全世界的線蟲生物學家查詢。用深度學習方式得出的piRNA相關網頁工具及資料庫目前在文獻中並不存在，我們做出來的話將是全世界第一個!本計畫第三年要把我們前兩年做piRNA累積的經驗和知識拿來研究另一種小型非編碼核醣核酸tRFs。我們將開發深度學習演算法來預測一條RNA上面可能有哪些tRFs的結合位置及將深度演算法訓練出來的網路模型包裝成網頁工具並拿來預測線蟲內每個基因的mRNA上面可能有哪些tRFs的結合位置並將結果整理成資料庫供全世界的線蟲生物學家查詢。這樣的網頁工具及資料庫目前在文獻中並不存在，我們做出來的話將是全世界第一個!
| Status | Finished |
|---|---|
| Effective start/end date | 20-08-01 → 21-07-31 |