探索蛋白質結構變化之整合平台

Translated title of the thesis: An integrated platform for exploring conformational change of proteins
  • 周 家緯

Student thesis: Master's Thesis

Abstract

結構變化在各種具有重要生物?能的蛋白質交互作用間廣泛的被觀察到,舉例來說:adenylate kinase (AdK)催化ATP分解成AMP及磷酸的轉移,過程中產生巨大的結構轉變 (從開放狀態轉換至封閉狀態),此結構轉換可能與基質或配體結合與後轉錄調控有關,如:磷酸化。已有?多研究將蛋白質特性可視化,如:將蛋白質每個胺基酸之演化保留度以圖形顯示。但大部份的研究皆著眼於蛋白質本質特性,而非蛋白質結構轉變。 本研究提供精緻且人性化的使用者介面,使用者可使用互動式圖表與3D立體結構來觀察結構轉變,使用者可以看到蛋白質結合造成的結構轉變,同時,本研究也提供了全面性的資訊,包含:sequence domains、structural domains、phosphorylation sites、catalytic sites、secondary structures、disorder regions、conservation profile以及hydrophathy profile。使用者可以深入探討各種生物特性間的關聯,本篇研究也將有利於各領域的探討,如:protein disorder、secondary structure transition、protein flexibility/plasticity、protein interaction、post-translational modification與molecular dynamics。
Date of Award2014 Aug 22
Original languageChinese
SupervisorTien-Hao Chang (Supervisor)

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探索蛋白質結構變化之整合平台
家緯, 周. (Author). 2014 Aug 22

Student thesis: Master's Thesis