開發整合微核糖核酸預測資料庫的系統來辨識被一組微核醣核酸共同調控的標靶基因之研究

Abstract

微核醣核酸(microRNA miRNA)是一個不會被轉譯成蛋白質的小片段長度(~22核?酸長)的核醣核酸，同時，miRNA不僅可以藉由種子序列(Seed region)和mRNA的3’非轉譯區(3’-untranslated region 3’- UTR)互補，並抑制mRNA的蛋白質合成，造成微核醣核酸會影響到?多的生理?能，包括：細胞分化、細胞增生、細胞死亡、細胞生長等等。在過去的研究文獻也指出，由於單一的微核醣核酸會影響到上千個的基因，因此，在生物實驗驗證微核醣核酸的標靶基因上，會顯得十分耗成本及時間，所以，隨著時間的演進，微核醣核酸預測基因的資料庫也隨之而發展，藉由電腦化的計算來辨別其有可能被微核醣核酸調控的基因，目前為止，有很多實用的線上預測工具，如：miRanda、TargetScan、DIANA-microT、miRDB等等，但是，每個工具所預測的基因之結果不盡相同，因此，我們整合了線上微核醣核酸預測基因的工具來尋找真正被微核醣核酸調控的基因，除此之外，近年來有研究指出，多個miRNA也會針對單一基因進行共同調控，進而影響細胞的行為，所以，我們也提供額外的?能讓研究學家探討miRNA及基因之間的共同調控關係，並提供miRNA及基因表現量分析和新的miRNA預測基因之分數讓使用者可以更快速找到其符合的結果，總而言之，本研究所開發的整合微核醣核酸預測資料庫的系統提供方便、簡單、實用的?能讓研究學家使用。

Date of Award	2014 Aug 11
Original language	Chinese
Supervisor	Ta-Chien Tseng (Supervisor)