本系前身工商管理學系於四十四學年度成立，當時屬台灣省立工學院。四十五學年度台灣省立工學院改制並更名為台灣省立成功大學時，增設商學院，工商管理學系歸商學院。 民國六十年八月，台灣省立成功大學改制為國立成功大學，自六十一學年度起，兩組分別獨立成系，工業管理組成立工業管理學系，商業管理組成立企業管理學系。工業管理學系並於六十二學年度設置夜間部。 工業管理學系旨在培育具有工程學識的管理人才，學生須有良好的數理基礎，自六十三學年度起乃改屬甲組招生，並更名為工業管理科學系。六十九學年度，商學院改為管理學院，本系即為國立成功大學管理學院工業管理科學系。大學聯考本系招收第二類組新生。本系自民國五十八年起設有研究所碩士班，八十年成立研究所博士班。大學部日夜間部成績優異同學得申請推薦甄選就讀研究所碩士班，九十二學年改名為工業與資訊管理學系。 鑑於資訊科技蓬勃發展與知識經濟時代的來臨，企業電子化策略規劃以及兼具管理素養之管理人才的需求日殷，國立成功大學於民國八十七年成立資訊管理研究所碩士班，為國內培養企業中高階資訊管理人才；並進一步於九十四年成立資管博士班，培育具學術研究能力的資管專才，延續本所的教學縱深，俾使本校資訊管理高等教育體系完整化，為學術界及企業界培養更多資訊管理的專業人才。