本系創立於民國七十一年，與學校增設醫學院有密切的關係。本校以工學起家，後由台灣省立工學院改制為成功大學，並於民國七十年奉准增設醫學院，在籌備醫學院的過程中，夏漢民校長體認增設生物學系的重要性，於是申請並於民國七十一年奉准設立生物學系，將生物系館安排於緊臨醫學院區以加強兩者的聯繫。因為是學校第一個生物領域的系，因此系刊名”先驅”，即為生物醫學先驅之意。並於八十二年成立碩士班，陸續於八十八年成立博士班，由本系教師全力支援相關之研究與教學任務。近年來生命科學蓬勃發展，生物科技產業日新月異，本系有鑒於未來生物科學之發展趨勢，參考國內外知名大學生物教學之整合與改革，於民國九十三年更名為生命科學系，以培養基礎生物科學、現代生命科學與生物科技，及生物多樣性兼備的人才為宗旨。 本系除了擁有規劃齊全的系館外，並有各種先進之儀器，以強化及充實各項教學及研究，培養一流的生物科技人才。本系目前有19名專任師資，在研究上涵蓋生物醫學，基因體與生物科技，以及生態學，各領域間有密切的合作，以了解生物上細胞與個體運作的分子機制，與基因與環境的交互作用，以及最終極的演化等問題。其衍生的知識，可以運用在人類疾病的原理與治療，以及農業生物科技上，裨益大眾。