芒屬 ( Miscanthus ) 為禾本科（Poaceae）黍亞科 ( Panicoideae ) 植物，主要分佈於東亞及東南亞。八丈芒 （Miscanthus sinensis var condensatus）為中國芒（M sinensis）之亞種，生長於台灣東部濱海沿岸地區，其棲地受海水以及降雨淋餘影響，具備高強度曝曬、日溫差大、高度鹽分等條件，因此大部份植物無法在此生長。根據這樣的特殊棲地環境，我推測八丈芒之所以能夠在如此惡劣條件下生長，必定具備多種非生物耐受性基因被天擇所偏好，在此本研究特別針對鹽分耐受度進行探討。 藉由與已完成全基因體定序的禾本科物種互相比較，包括高粱 （Sorghum bicolor） 、玉米 （Zea mays） 、小米 （Setaria italic） 、柳枝稷 （Panicum virgatum） 、水稻 （Oryza sativa） 、二穗短柄草 （Brachypodium distachyon），並進行演化以及天擇選汰的分析。本研究串連 3 515 條直系同源基因 （orthologous genes） 畫出物種樹，結果呈現八丈芒與高粱為最近緣種，並和玉米同屬於蜀黍族，小米和柳枝稷則屬於黍族並與蜀黍族為近緣，水稻和二穗短柄草則為外群。在 3 515 條直系同源基因中， 2 007 條基因的親緣樹與物種樹相符， 1 521 條基因發生過重組事件，2 094 條基因具有 GO （gene ontology）註解。 在這些基因中，我們鎖定 12 個與離子運輸相關的註解，包括 transport 、 transmembrane transport 、 ferrous iron transport 、 potassium ion transport / transmembrane transport 、 response to aluminum ion / metal ion 、 citrate transport 、 regulation of anion transport 、 anion / cation / metal ion transport ，其中 iron ion tranamembrane transport potassium ion transport response to metal ion ferrous iron transport response to aluminum ion 分類群的同源基因其受正向天擇偏好比率為 100 %，這些 GO term ?能都與離子的濃度有關，旨在調控生物膜內外的電位差平衡，這些 GO 的?能以及天擇基因的表現也顯現八丈芒在高鹽逆境下的天擇偏好。
以比較基因體學探討八丈芒之演化歷程與適應
威宇, 陳. (Author). 2015 11月 25
學生論文: Master's Thesis