探索蛋白質結構變化之整合平台

摘要

結構變化在各種具有重要生物?能的蛋白質交互作用間廣泛的被觀察到，舉例來說：adenylate kinase (AdK)催化ATP分解成AMP及磷酸的轉移，過程中產生巨大的結構轉變 (從開放狀態轉換至封閉狀態)，此結構轉換可能與基質或配體結合與後轉錄調控有關，如：磷酸化。已有?多研究將蛋白質特性可視化，如：將蛋白質每個胺基酸之演化保留度以圖形顯示。但大部份的研究皆著眼於蛋白質本質特性，而非蛋白質結構轉變。 本研究提供精緻且人性化的使用者介面，使用者可使用互動式圖表與3D立體結構來觀察結構轉變，使用者可以看到蛋白質結合造成的結構轉變，同時，本研究也提供了全面性的資訊，包含：sequence domains、structural domains、phosphorylation sites、catalytic sites、secondary structures、disorder regions、conservation profile以及hydrophathy profile。使用者可以深入探討各種生物特性間的關聯，本篇研究也將有利於各領域的探討，如：protein disorder、secondary structure transition、protein flexibility/plasticity、protein interaction、post-translational modification與molecular dynamics。

獎項日期	2014 8月 22
原文	???core.languages.zh_ZH???
監督員	Tien-Hao Chang (Supervisor)